Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms