Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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