Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Actrt2Q9D9L5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms