Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms