Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms