Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D3J9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms