Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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