Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SdhdQ9CXV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms