Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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