Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms