Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms