Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccer1Q9CQL2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms