Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DenrQ9CQJ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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DenrQ9CQJ6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DenrQ9CQJ6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DenrQ9CQJ6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DenrQ9CQJ6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DenrQ9CQJ6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms