Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dph6Q9CQ28 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dph6Q9CQ28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms