Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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