Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms