Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6bQ99N09 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ms4a6bQ99N09 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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