Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clint1Q99KN9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clint1Q99KN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clint1Q99KN9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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