Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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