Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms