Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ApobrQ8VBT6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms