Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim29Q8R2Q0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms