Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms