Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms