Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnma3Q8JZW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms