Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hpf1Q8CFE2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hpf1Q8CFE2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms