Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc8Q8CFD5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ercc8Q8CFD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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