Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms