Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx16Q8C080 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Snx16Q8C080 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms