Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik4Q8BMF5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik4Q8BMF5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms