Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrtm2Q8BGA3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrtm2Q8BGA3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrtm2Q8BGA3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Lrrtm2Q8BGA3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms