Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrl2Q8BG73 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms