Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbed4Q80WQ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Zbed4Q80WQ9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Zbed4Q80WQ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zbed4Q80WQ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zbed4Q80WQ9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms