Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms