Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk13Q69ZA1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms