Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms