Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpd52Q62393 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms