Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Foxd1Q61345 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd1Q61345 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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