Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms