Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JrkQ60976 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms