Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mkrn3Q60764 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms