Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms