Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim38Q5SZ99 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Trim38Q5SZ99 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Trim38Q5SZ99 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms