Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms