Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata48Q5NC83 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms