Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdv3Q4VAA2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms