Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms