Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms