Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms