Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp39Q3TIX9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms